J'avais eu ce probleme sur ma xantia HDI de 99, mais jamais sur mes 406 suivantes.
Il y avait eu un souci de mise à l'air du réservoir, mais ca ne doit pas etre le cas sur la tienne, et le faisceau qui va de la pompe aux injecteur qui se dessere.
Quant au symptome c'était comme toi des calages intempestifs ou des refus de démarrage, puis ca repartait comme par magie.
Sur une 206 HDI du taf aussi il y a eu ce souci qui provoquait des trainée sur la carrosserie...